Protein–RNA interactions for Protein: P18077

RPL35A, 60S ribosomal protein L35a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35AP18077 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL35AP18077 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms