Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF7P17544 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF7P17544 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF7P17544 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF7P17544 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF7P17544 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF7P17544 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF7P17544 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF7P17544 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF7P17544 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF7P17544 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF7P17544 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF7P17544 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF7P17544 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF7P17544 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF7P17544 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF7P17544 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF7P17544 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF7P17544 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF7P17544 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF7P17544 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF7P17544 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF7P17544 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF7P17544 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF7P17544 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF7P17544 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF7P17544 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF7P17544 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF7P17544 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF7P17544 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF7P17544 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF7P17544 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF7P17544 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF7P17544 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms