Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
UBTFP17480 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
UBTFP17480 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
UBTFP17480 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
UBTFP17480 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
UBTFP17480 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
UBTFP17480 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
UBTFP17480 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
UBTFP17480 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
UBTFP17480 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
UBTFP17480 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
UBTFP17480 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
UBTFP17480 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
UBTFP17480 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
UBTFP17480 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
UBTFP17480 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
UBTFP17480 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
UBTFP17480 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
UBTFP17480 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
UBTFP17480 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
UBTFP17480 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
UBTFP17480 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
UBTFP17480 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
UBTFP17480 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
UBTFP17480 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
UBTFP17480 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
UBTFP17480 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
UBTFP17480 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
UBTFP17480 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
UBTFP17480 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
UBTFP17480 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
UBTFP17480 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
UBTFP17480 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
UBTFP17480 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
UBTFP17480 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
UBTFP17480 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
UBTFP17480 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
UBTFP17480 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
UBTFP17480 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
UBTFP17480 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
UBTFP17480 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
UBTFP17480 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
UBTFP17480 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
UBTFP17480 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
UBTFP17480 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
UBTFP17480 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
UBTFP17480 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBTFP17480 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBTFP17480 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBTFP17480 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBTFP17480 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBTFP17480 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBTFP17480 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBTFP17480 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBTFP17480 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBTFP17480 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBTFP17480 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBTFP17480 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBTFP17480 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
UBTFP17480 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBTFP17480 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBTFP17480 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBTFP17480 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
UBTFP17480 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
UBTFP17480 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
UBTFP17480 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
UBTFP17480 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
UBTFP17480 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
UBTFP17480 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
UBTFP17480 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
UBTFP17480 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBTFP17480 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBTFP17480 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBTFP17480 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
UBTFP17480 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBTFP17480 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBTFP17480 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBTFP17480 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
UBTFP17480 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
UBTFP17480 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBTFP17480 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBTFP17480 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBTFP17480 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBTFP17480 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
UBTFP17480 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
UBTFP17480 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
UBTFP17480 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
UBTFP17480 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
UBTFP17480 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
UBTFP17480 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBTFP17480 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBTFP17480 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
UBTFP17480 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBTFP17480 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBTFP17480 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBTFP17480 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBTFP17480 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
UBTFP17480 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBTFP17480 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBTFP17480 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms