Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCFC2P16383 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCFC2P16383 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GCFC2P16383 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GCFC2P16383 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms