Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CREB1P16220 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CREB1P16220 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CREB1P16220 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREB1P16220 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CREB1P16220 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREB1P16220 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREB1P16220 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREB1P16220 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREB1P16220 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREB1P16220 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREB1P16220 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREB1P16220 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREB1P16220 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREB1P16220 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CREB1P16220 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CREB1P16220 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CREB1P16220 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CREB1P16220 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB1P16220 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB1P16220 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB1P16220 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB1P16220 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB1P16220 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB1P16220 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB1P16220 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB1P16220 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB1P16220 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CREB1P16220 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB1P16220 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB1P16220 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB1P16220 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB1P16220 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB1P16220 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB1P16220 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB1P16220 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB1P16220 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB1P16220 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB1P16220 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB1P16220 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB1P16220 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB1P16220 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CREB1P16220 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CREB1P16220 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB1P16220 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB1P16220 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB1P16220 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB1P16220 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB1P16220 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB1P16220 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB1P16220 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB1P16220 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB1P16220 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB1P16220 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB1P16220 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB1P16220 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms