Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF2RAP15509 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF2RAP15509 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms