Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFTRP13569 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFTRP13569 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFTRP13569 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFTRP13569 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFTRP13569 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFTRP13569 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFTRP13569 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFTRP13569 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFTRP13569 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFTRP13569 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFTRP13569 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFTRP13569 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
CFTRP13569 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CFTRP13569 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CFTRP13569 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CFTRP13569 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CFTRP13569 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CFTRP13569 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CFTRP13569 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CFTRP13569 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFTRP13569 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFTRP13569 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFTRP13569 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFTRP13569 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFTRP13569 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFTRP13569 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFTRP13569 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFTRP13569 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFTRP13569 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CFTRP13569 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFTRP13569 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFTRP13569 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFTRP13569 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFTRP13569 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFTRP13569 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFTRP13569 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFTRP13569 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFTRP13569 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFTRP13569 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFTRP13569 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFTRP13569 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFTRP13569 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFTRP13569 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFTRP13569 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFTRP13569 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFTRP13569 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFTRP13569 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CFTRP13569 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFTRP13569 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
CFTRP13569 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFTRP13569 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFTRP13569 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFTRP13569 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFTRP13569 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFTRP13569 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFTRP13569 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFTRP13569 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CFTRP13569 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFTRP13569 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CFTRP13569 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CFTRP13569 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFTRP13569 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFTRP13569 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFTRP13569 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFTRP13569 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFTRP13569 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFTRP13569 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFTRP13569 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFTRP13569 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFTRP13569 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CFTRP13569 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFTRP13569 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFTRP13569 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CFTRP13569 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFTRP13569 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFTRP13569 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFTRP13569 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFTRP13569 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFTRP13569 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFTRP13569 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CFTRP13569 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFTRP13569 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFTRP13569 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFTRP13569 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms