Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC5P13010 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC5P13010 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms