Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN1P12814 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTN1P12814 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTN1P12814 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms