Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKBP12277 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKBP12277 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKBP12277 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKBP12277 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKBP12277 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKBP12277 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKBP12277 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKBP12277 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKBP12277 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKBP12277 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKBP12277 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKBP12277 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CKBP12277 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CKBP12277 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKBP12277 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKBP12277 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKBP12277 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKBP12277 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKBP12277 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKBP12277 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKBP12277 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKBP12277 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKBP12277 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKBP12277 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKBP12277 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKBP12277 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKBP12277 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKBP12277 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKBP12277 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKBP12277 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKBP12277 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKBP12277 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKBP12277 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKBP12277 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKBP12277 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKBP12277 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKBP12277 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKBP12277 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKBP12277 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKBP12277 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CKBP12277 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKBP12277 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKBP12277 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKBP12277 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKBP12277 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CKBP12277 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CKBP12277 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CKBP12277 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKBP12277 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKBP12277 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKBP12277 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKBP12277 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKBP12277 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CKBP12277 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKBP12277 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKBP12277 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKBP12277 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKBP12277 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKBP12277 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKBP12277 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKBP12277 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKBP12277 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKBP12277 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKBP12277 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKBP12277 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKBP12277 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKBP12277 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms