Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT3P12035 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT3P12035 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT3P12035 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT3P12035 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT3P12035 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT3P12035 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT3P12035 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT3P12035 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT3P12035 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT3P12035 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT3P12035 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT3P12035 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT3P12035 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT3P12035 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT3P12035 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT3P12035 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT3P12035 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT3P12035 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT3P12035 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT3P12035 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT3P12035 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT3P12035 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT3P12035 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT3P12035 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT3P12035 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT3P12035 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT3P12035 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT3P12035 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT3P12035 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT3P12035 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT3P12035 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT3P12035 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT3P12035 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT3P12035 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms