Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2P10911 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2P10911 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2P10911 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2P10911 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2P10911 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2P10911 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2P10911 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2P10911 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2P10911 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2P10911 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2P10911 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2P10911 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2P10911 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2P10911 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2P10911 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2P10911 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2P10911 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2P10911 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2P10911 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2P10911 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2P10911 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2P10911 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2P10911 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2P10911 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2P10911 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2P10911 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2P10911 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2P10911 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2P10911 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2P10911 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2P10911 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2P10911 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCF2P10911 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCF2P10911 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2P10911 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2P10911 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2P10911 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2P10911 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2P10911 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2P10911 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2P10911 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2P10911 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCF2P10911 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2P10911 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2P10911 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2P10911 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2P10911 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2P10911 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2P10911 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2P10911 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2P10911 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2P10911 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCF2P10911 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms