Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARBP10826 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARBP10826 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARBP10826 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARBP10826 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RARBP10826 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RARBP10826 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RARBP10826 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARBP10826 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARBP10826 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARBP10826 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARBP10826 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARBP10826 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RARBP10826 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARBP10826 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RARBP10826 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARBP10826 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARBP10826 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARBP10826 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARBP10826 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARBP10826 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARBP10826 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARBP10826 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARBP10826 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARBP10826 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARBP10826 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RARBP10826 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARBP10826 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RARBP10826 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARBP10826 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARBP10826 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARBP10826 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARBP10826 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARBP10826 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RARBP10826 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms