Protein–RNA interactions for Protein: P10619

CTSA, Lysosomal protective protein, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSAP10619 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSAP10619 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSAP10619 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSAP10619 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSAP10619 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSAP10619 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSAP10619 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSAP10619 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSAP10619 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSAP10619 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSAP10619 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSAP10619 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSAP10619 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSAP10619 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSAP10619 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSAP10619 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSAP10619 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSAP10619 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSAP10619 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSAP10619 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSAP10619 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSAP10619 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSAP10619 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSAP10619 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSAP10619 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSAP10619 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSAP10619 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSAP10619 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSAP10619 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSAP10619 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSAP10619 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSAP10619 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSAP10619 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSAP10619 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSAP10619 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSAP10619 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSAP10619 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSAP10619 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSAP10619 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSAP10619 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTSAP10619 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSAP10619 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSAP10619 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTSAP10619 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSAP10619 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSAP10619 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSAP10619 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSAP10619 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSAP10619 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSAP10619 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSAP10619 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSAP10619 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSAP10619 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSAP10619 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSAP10619 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSAP10619 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTSAP10619 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSAP10619 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSAP10619 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSAP10619 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSAP10619 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSAP10619 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSAP10619 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSAP10619 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms