Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR2F1P10589 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR2F1P10589 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms