Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HKR1P10072 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HKR1P10072 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HKR1P10072 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HKR1P10072 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HKR1P10072 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HKR1P10072 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HKR1P10072 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HKR1P10072 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HKR1P10072 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HKR1P10072 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HKR1P10072 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms