Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM17P0DL12 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms