Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD1P0DJD0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD1P0DJD0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms