Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM228BP0C875 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms