Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC172P0C7W6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC172P0C7W6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms