Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIL1P09327 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIL1P09327 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIL1P09327 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIL1P09327 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIL1P09327 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIL1P09327 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIL1P09327 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIL1P09327 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIL1P09327 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIL1P09327 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIL1P09327 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIL1P09327 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIL1P09327 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIL1P09327 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIL1P09327 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VIL1P09327 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIL1P09327 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIL1P09327 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIL1P09327 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIL1P09327 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIL1P09327 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIL1P09327 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIL1P09327 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIL1P09327 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIL1P09327 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIL1P09327 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIL1P09327 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIL1P09327 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIL1P09327 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VIL1P09327 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIL1P09327 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIL1P09327 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIL1P09327 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIL1P09327 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIL1P09327 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIL1P09327 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VIL1P09327 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIL1P09327 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIL1P09327 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIL1P09327 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIL1P09327 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIL1P09327 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIL1P09327 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIL1P09327 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIL1P09327 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIL1P09327 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIL1P09327 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIL1P09327 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIL1P09327 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VIL1P09327 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIL1P09327 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIL1P09327 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIL1P09327 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIL1P09327 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIL1P09327 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIL1P09327 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms