Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACAA1P09110 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACAA1P09110 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms