Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOP08100 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOP08100 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOP08100 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOP08100 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOP08100 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOP08100 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOP08100 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOP08100 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOP08100 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOP08100 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOP08100 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOP08100 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOP08100 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOP08100 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOP08100 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOP08100 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOP08100 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOP08100 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOP08100 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOP08100 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOP08100 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOP08100 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOP08100 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOP08100 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOP08100 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOP08100 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOP08100 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOP08100 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOP08100 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOP08100 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOP08100 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOP08100 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOP08100 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOP08100 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOP08100 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOP08100 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOP08100 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOP08100 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOP08100 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOP08100 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOP08100 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOP08100 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOP08100 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOP08100 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOP08100 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOP08100 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOP08100 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOP08100 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOP08100 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOP08100 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOP08100 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOP08100 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOP08100 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOP08100 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOP08100 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOP08100 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOP08100 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOP08100 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOP08100 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOP08100 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOP08100 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOP08100 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOP08100 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOP08100 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOP08100 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOP08100 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms