Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM2P07951 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM2P07951 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM2P07951 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM2P07951 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM2P07951 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM2P07951 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM2P07951 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPM2P07951 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TPM2P07951 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TPM2P07951 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TPM2P07951 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TPM2P07951 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TPM2P07951 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPM2P07951 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM2P07951 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM2P07951 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM2P07951 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM2P07951 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM2P07951 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM2P07951 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM2P07951 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPM2P07951 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPM2P07951 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM2P07951 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM2P07951 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM2P07951 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM2P07951 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM2P07951 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM2P07951 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM2P07951 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM2P07951 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM2P07951 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM2P07951 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM2P07951 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM2P07951 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM2P07951 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM2P07951 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPM2P07951 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM2P07951 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM2P07951 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM2P07951 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM2P07951 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM2P07951 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM2P07951 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM2P07951 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM2P07951 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM2P07951 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM2P07951 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM2P07951 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM2P07951 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM2P07951 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM2P07951 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPM2P07951 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM2P07951 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM2P07951 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM2P07951 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM2P07951 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM2P07951 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM2P07951 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM2P07951 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM2P07951 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM2P07951 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM2P07951 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM2P07951 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM2P07951 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPM2P07951 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms