Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DOAP06340 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-DOAP06340 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms