Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IFNA4P05014 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFNA4P05014 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms