Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYMSP04818 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYMSP04818 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TYMSP04818 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TYMSP04818 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TYMSP04818 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TYMSP04818 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYMSP04818 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYMSP04818 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TYMSP04818 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TYMSP04818 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TYMSP04818 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TYMSP04818 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms