Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL10P02778 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL10P02778 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms