Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RP00736 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RP00736 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RP00736 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RP00736 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RP00736 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RP00736 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RP00736 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RP00736 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RP00736 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RP00736 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RP00736 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RP00736 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RP00736 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RP00736 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RP00736 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RP00736 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RP00736 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RP00736 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RP00736 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RP00736 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RP00736 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RP00736 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RP00736 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RP00736 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RP00736 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1RP00736 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1RP00736 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RP00736 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RP00736 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RP00736 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RP00736 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RP00736 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RP00736 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RP00736 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RP00736 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RP00736 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RP00736 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RP00736 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RP00736 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RP00736 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RP00736 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RP00736 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RP00736 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1RP00736 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1RP00736 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1RP00736 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1RP00736 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1RP00736 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1RP00736 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1RP00736 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1RP00736 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1RP00736 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1RP00736 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1RP00736 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1RP00736 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1RP00736 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1RP00736 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1RP00736 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1RP00736 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1RP00736 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C1RP00736 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1RP00736 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1RP00736 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1RP00736 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1RP00736 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1RP00736 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RP00736 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms