Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
F13A1P00488 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
F13A1P00488 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
F13A1P00488 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
F13A1P00488 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F13A1P00488 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F13A1P00488 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F13A1P00488 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
F13A1P00488 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
F13A1P00488 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
F13A1P00488 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
F13A1P00488 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F13A1P00488 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
F13A1P00488 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
F13A1P00488 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F13A1P00488 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
F13A1P00488 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
F13A1P00488 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13A1P00488 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F13A1P00488 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F13A1P00488 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F13A1P00488 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F13A1P00488 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
F13A1P00488 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F13A1P00488 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
F13A1P00488 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F13A1P00488 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
F13A1P00488 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
F13A1P00488 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
F13A1P00488 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
F13A1P00488 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
F13A1P00488 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
F13A1P00488 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
F13A1P00488 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
F13A1P00488 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
F13A1P00488 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
F13A1P00488 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
F13A1P00488 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
F13A1P00488 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
F13A1P00488 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
F13A1P00488 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
F13A1P00488 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
F13A1P00488 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
F13A1P00488 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
F13A1P00488 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F13A1P00488 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F13A1P00488 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F13A1P00488 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
F13A1P00488 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F13A1P00488 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F13A1P00488 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
F13A1P00488 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
F13A1P00488 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
F13A1P00488 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
F13A1P00488 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
F13A1P00488 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
F13A1P00488 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
F13A1P00488 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
F13A1P00488 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
F13A1P00488 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
F13A1P00488 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
F13A1P00488 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
F13A1P00488 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
F13A1P00488 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
F13A1P00488 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
F13A1P00488 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
F13A1P00488 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F13A1P00488 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F13A1P00488 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
F13A1P00488 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
F13A1P00488 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
F13A1P00488 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F13A1P00488 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
F13A1P00488 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F13A1P00488 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
F13A1P00488 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F13A1P00488 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F13A1P00488 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
F13A1P00488 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
F13A1P00488 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F13A1P00488 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F13A1P00488 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F13A1P00488 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F13A1P00488 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F13A1P00488 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms