Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTLL1O95922 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTLL1O95922 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms