Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5LO95447 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms