Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCELO95171 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCELO95171 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCELO95171 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCELO95171 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCELO95171 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCELO95171 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCELO95171 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCELO95171 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCELO95171 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCELO95171 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCELO95171 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCELO95171 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCELO95171 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCELO95171 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCELO95171 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCELO95171 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCELO95171 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCELO95171 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCELO95171 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCELO95171 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCELO95171 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCELO95171 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCELO95171 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCELO95171 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCELO95171 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCELO95171 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCELO95171 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCELO95171 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCELO95171 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCELO95171 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCELO95171 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCELO95171 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCELO95171 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCELO95171 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCELO95171 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCELO95171 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCELO95171 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCELO95171 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCELO95171 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCELO95171 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCELO95171 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCELO95171 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCELO95171 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCELO95171 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCELO95171 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCELO95171 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.7 ms