Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC31AO94979 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC31AO94979 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC31AO94979 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC31AO94979 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms