Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRIG2O94898 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIG2O94898 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms