Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLIT2O94813 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms