Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ECM2O94769 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM2O94769 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM2O94769 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM2O94769 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM2O94769 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM2O94769 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM2O94769 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM2O94769 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM2O94769 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM2O94769 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM2O94769 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM2O94769 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM2O94769 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM2O94769 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM2O94769 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM2O94769 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM2O94769 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM2O94769 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM2O94769 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM2O94769 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM2O94769 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM2O94769 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM2O94769 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM2O94769 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM2O94769 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM2O94769 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM2O94769 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM2O94769 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM2O94769 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM2O94769 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM2O94769 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM2O94769 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM2O94769 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM2O94769 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM2O94769 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM2O94769 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM2O94769 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM2O94769 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM2O94769 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM2O94769 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM2O94769 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM2O94769 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM2O94769 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM2O94769 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM2O94769 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM2O94769 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM2O94769 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM2O94769 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM2O94769 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM2O94769 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM2O94769 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM2O94769 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM2O94769 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM2O94769 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM2O94769 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM2O94769 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms