Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPFIA4O75335 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms