Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TIMM17BO60830 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TIMM17BO60830 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TIMM17BO60830 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TIMM17BO60830 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
TIMM17BO60830 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TIMM17BO60830 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TIMM17BO60830 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms