Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL4O60488 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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