Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PPLO60437 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PPLO60437 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPLO60437 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPLO60437 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPLO60437 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPLO60437 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPLO60437 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPLO60437 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPLO60437 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPLO60437 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPLO60437 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPLO60437 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPLO60437 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPLO60437 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPLO60437 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPLO60437 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPLO60437 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPLO60437 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PPLO60437 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PPLO60437 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPLO60437 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PPLO60437 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPLO60437 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPLO60437 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPLO60437 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPLO60437 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPLO60437 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPLO60437 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPLO60437 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPLO60437 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPLO60437 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPLO60437 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPLO60437 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPLO60437 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPLO60437 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PPLO60437 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PPLO60437 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPLO60437 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPLO60437 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPLO60437 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPLO60437 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPLO60437 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPLO60437 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPLO60437 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PPLO60437 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PPLO60437 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPLO60437 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPLO60437 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPLO60437 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPLO60437 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPLO60437 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPLO60437 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPLO60437 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PPLO60437 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PPLO60437 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms