Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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VEGFDO43915 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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VEGFDO43915 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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VEGFDO43915 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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VEGFDO43915 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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VEGFDO43915 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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VEGFDO43915 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VEGFDO43915 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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