Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYTH3O43739 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYTH3O43739 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms