Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTATSF1O43719 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTATSF1O43719 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms