Protein–RNA interactions for Protein: O43555

GNRH2, Progonadoliberin-2, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNRH2O43555 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNRH2O43555 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms