Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNQ3O43525 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNQ3O43525 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNQ3O43525 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNQ3O43525 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNQ3O43525 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNQ3O43525 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNQ3O43525 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNQ3O43525 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNQ3O43525 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNQ3O43525 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNQ3O43525 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNQ3O43525 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KCNQ3O43525 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms