Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBFA2T2O43439 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms