Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP3O43295 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP3O43295 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms