Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLXNB1O43157 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PLXNB1O43157 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms