Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF113AO15541 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF113AO15541 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF113AO15541 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF113AO15541 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF113AO15541 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF113AO15541 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF113AO15541 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms